PromethION 2 Solo to kompaktowy system sekwencjonowania III generacji od Oxford Nanopore Technologies, który umożliwia elastyczne i skalowalne sekwencjonowanie DNA i RNA. Dzięki technologii nanoporowej pozwala na generowanie długich odczytów, co czyni go doskonałym narzędziem do analizy genomów, transkryptomiki i epigenomiki. Urządzenie umożliwia jednoczesne lub indywidualne przeprowadzenie do dwóch eksperymentów sekwencjonowania.

PromethION 2 Solo

P2 Flow Cell

Specyfikacja techniczna

• Maksymalna ilość danych na cykl: do 580 Gb danych na przebieg (2 × 290 Gb/flow cell)
• Technologia: Nanoporowa (Oxford Nanopore)
• Wydajność na Flow Cell:
- • 100-200 Gb dla odczytów natywnego gDNA (odczyt N50 -25 kb)
- • 50-100 Gb dla ultradługich odczytów natywnego DNA (odczyt N50 >50 kb)
- • >200 Gb dla próbek metagenomicznych (odczyt N50 ~ 10 kb)
• Długość odczytów: Od 20 bp do >4 Mb (średnia N50: 25-50 kb)
• Czas przebiegu: 6-72 godziny
• Dokładność (tryb duplex): >99% odczytów powyżej Q31
• Dokładność (tryb simplex): >99,3% odczytów powyżej Q20
• Ilość próbek na flow cell: możliwość multipleksowania sekwencjonowania do 96 próbek na 1 flow cell
• MinKNOW: prosty inticyjny interface graficzny
• EPI2ME: platforma pozwalająca na analizę danych w czasie rzeczywistym

Możliwości i zastosowania

• Sekwencjonowanie natywnego DNA i RNA - umożliwia sekwencjonowanie natywnych cząsteczek DNA i RNA bez amplifikacji PCR, co pozwala uniknąć artefaktów i zachować informacje o modyfikacjach
• Epigenetyka - wykrywanie metylacji DNA/RNA - technologia nanoporowa pozwala na bezpośrednie wykrywanie modyfikacji DNA (np. 5mC, 5hmC) i RNA (epitranskryptomów) w czasie sekwencjonowania, bez konieczności dodatkowych etapów
• Odczyt złożonych regionów genomicznych - długie odczyty (do >4 Mb) umożliwiają analizę trudnych regionów genomu, takich jak sekwencje powtórzone, regiony heterochromatynowe i duże rearanżacje chromosomowe
• Analiza ekspresji genów - system pozwala na pełną analizę transkryptomu, w tym identyfikację izoform genów, pomiar ekspresji genów i analizę transkryptomiki pojedynczych komórek.
• Metagenomika - umożliwia identyfikację patogenów, charakterystykę mikrobiomu z rozdzielczością szczepową i analizę wirusowych quasi-gatunków w złożonych próbkach środowiskowych i klinicznych

• Więcej zastosowań aplikacyjnych znajdą Państwo poniżej

Więcej informacji

Strona producenta PromethION 2 Solo Przejdź do strony zewnętrznej

Zastosowania aplikacyjne dla promethION Przejdź do strony zewnętrznej